Cотрудники института
 
 
 
   

Кириллин Михаил Юрьевич
С.н.с. отдела радиофизических методов в медицине, лаборатория биофотоники
к.ф.-м.н.

Образование:
2008 – степень доктора технологии, Тема диссертации «Оптическая когерентная томография сильнорассеивающих сред», научный руководитель – Р. Мюллюля
2004 – 2008: аспирант университета Оулу (Финляндия)
2006 – степень к.ф.-м.н. по специальности «лазерная физика». Тема диссертации: «Распространение света в сильнорассеивающих средах и формирование сигналов в системах лазерной диагностики», научный руководитель – А.В. Приезжев
2003 – 2006: аспирант физического факультета Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова
2003 – (красный) диплом специалиста по специальности «физика»
2001 – 2004: студент Российско-германского института науки и культуры
1997 - 2003: студент физического факультета Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова

Область научных интересов:
Распространение излучения в мутных средах

  • Теория переноса излучения в мутных средах, применение для биотканей
  • Моделирование распространения света в мутных средах (метод Монте-Карло)
  • Оптические методы биомедицинской диагностики
  • Влияние наночастиц на характер распространение излучения в мутных средах
  • Оптическое просветление
  • Оптика крови
  • Оптика кожи
  • Оптические методы контроля материалов
  • Оптика бумаги

Оптическая когерентная томография (ОКТ)

  • Неинвазивный мониторинг оптических свойства биотканей
  • Мониторинг уровня глюкозы в крови с помощью ОКТ
  • Монте-Карло моделирование ОКТ-изображений
  • ОКТ-исследование образцов бумаги
  • Методы контрастирования для повышения информативности ОКТ

Оптическая диффузионная томография
Диффузионная флуоресцентная томография

Профессиональная карьера:
  2011 – н.в.: старший научный сотрудник Института прикладной физики РАН
2011 – 2012: старший научный сотрудник Нижегородского государственного университета (совм.)
2008 – 2011: научный сотрудник Института прикладной физики РАН
2004 – 2008: исследователь, университет Оулу (Финляндия)

Научные визиты:
2010, 2012: приглашенный исследователь, Королевский Технологический институт (Стокгольм, Швеция)
2009, 2010, 2012: приглашенный исследователь, университет Оулу (Финляндия)
2008: приглашенный исследователь, университет Крэнфилда (Великобритания)

Членство в профессиональных организациях:
2002 – н.в.: Международное общество оптических инженеров (SPIE).
2007- 2008: Финское оптическое общество (FOS)
2011- н.в. рецензент журнала Biomedical Optics Express
2008 – н.в. рецензент журналов Optics Express, Applied Optics, Journal of Optics and Laser technologies, Optics Letters, JIOHS, Journal of Biomedical Optics, JOSA, Оптикаи Спектроскопия.
2007 – н.в. рецензент журнала Journal of Biophotonics
2006 – н.в. рецензент журнала Квантовая Электроника
2013 научный секретарь семинара “Clinical Biophotonics” международной конференции “Topical Problems of Biophotonics (TBP 2013)
2011 научный секретарь германо-российского семинара “Clinical Biophotonics” в рамках международной конференции “Topical Problems of Biophotonics (TBP 2011)
2011 член оргкомитета международной конференции “Topical Problems of Biophotonics (TBP 2011)”
2010 член программного комитета секции «Биофотоника» международной конференции ICONO/LAT 2010
2010, 2012 – приглашенный редактор спецвыпусков  JournalofBiophotonics
2009 член оргкомитета международной конференции “Topical Problems of Biophotonics (TBP 2009)”
2009 научный секретарь российско-франко-германского семинара Russian-French-German Laser Symposium 2009 (RFGLS 2009)
2007 член оргкомитета международной конференции Advanced Laser Technologies (ALT 2007)
2004 член оргкомитета Высшей лазерной школы “Modern Problems of Laser Physics”
2002 – 2003: казначей студенческой ячейки SPIE МГУ

Награды, премии, гранты:
2012 – лауреат конкурса Intel прикладных разработок и исследований в области компьютерных технологий «Компьютерный континуум: от идеи до воплощения»
2012 – диплом 1 степени победителя конкурса научных работ молодых ученых в области медицинской физики
2007 – грант фонда Тауно Тённинга (Финляндия)
2005 – образовательная стипендия SPIE (США)
2005 – диплом за лучший стендовый доклад международной школы “Modern Biophysical Techniques for Human Health” (Румыния)
2004 – стипендия Президента РФ
2004 – диплом международной конференции "Ломоносов 2004" за лучший доклад на секции
2003 – диплом Международного лазерного центра

Руководство научными проектами:
 2012-2013: проект ФЦП "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" на 2009 - 2013 годы "Развитие методов оптической диагностики биологических объектов с применением наноразмерных контрастирующих агентов"
2010-2011: Грант Президента РФ для поддержки молодых российских ученых-кандидатов наук «Формирование томографических изображений биотканей в условиях внешних воздействий»
2009-2011: Грант РФФИ «Исследование влияния механической деформации на оптические свойства биотканей методом поляризационно-чувствительной оптической когерентной томографии»
2009-2010: Грант РФФИ «Разработка методов увеличения контраста томографических изображений сильнорассеивающих объектов в биомедицинской диагностике»

Количество публикаций:
33 статьи в рецензируемых журналах, 3 главы в книгах, 120 статей в научных сборниках и материалах конференций

Наиболее значительные работы и результаты:

Статьи в рецензируемых журналах

  1. П.Д. Агрба, Е.А. Бакшаева, Д.О. Эллинский, И.Л. Шливко, М.Ю. Кириллин “Роль механической компрессии при визуализации кожи человека методом кросс-поляризационной оптической когерентной томографии”, Современные технологии в медицине, 6(1) в печати (2014).
  2. V. O. Korhonen, T. S. Myllylä, M.Yu. Kirillin, A. Popov, A. Bykov, A.V. Gorshkov, E.A. Sergeeva, M. Kinnunen, V. Kiviniemi, “Light propagation in near-infrared spectroscopy of the human brain”, IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics, in print (2014).
  3. Губарькова Е.В., Кириллин М.Ю., Сергеева Е.А., Киселева Е.Б., Снопова Л. Б., Проданец Н.Н., Шарабрин Е.Г., Шахов Е.Б., Немирова С.В., Гладкова Н.Д., “Кросс-поляризационная оптическая когерентная томография в оценке структуры атеросклеротической бляшки”, Современные технологии в медицине, 5(4), 24-34 (2013)
  4. А.Д. Крайнов, А.М. Мокеева, Е.А Сергеева, П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, «Оптические свойства биотканей мыши и их оптических фантомов» Оптика и спектроскопия, 115(2), 47-54 (2013).
  5. A.V. Gorshkov, M.Yu. Kirillin, “Monte Carlo simulation of brain sensing by optical diffuse spectroscopy”, Journal of Computational Science, 3, 498–503, (2012).
  6. R. Su, M. Kirillin, P. Ekberg, A. Roos, E. Sergeeva, L. Mattsson “Optical coherence tomography for quality assessment of embedded microchannels in alumina ceramic”, Optics Express, 20(4),4603-4618(2012).
  7. M. Kirillin, O. Panteleeva, E. Yunusova, E. Donchenko, and N. Shakhova “Criteria for pathology recognition in OCT of fallopian tubes“, Journal of Biomedical Optics, 17, 081413(2012).
  8. О.Г. Пантелеева, Б.Е. Шахов, К.Э Юнусова, М.Ю. Кириллин и Н.М. Шахова «Оптическая интроскопия - новый метод диагностики в репродуктивной медицине», Вестник радиологии и рентгенологии, 4, 50-55 (2012)
  9. M.A. Sirotkina, M.V. Shirmanova, M.L.Bugrova, V.V. Elagin, .P.D. Agrba, M.Yu. Kirillin, V.A. Kamensky, E.V. Zagaynova, “Continuous optical coherence tomography monitoring of nanoparticles accumulation in biological tissues”, Journal of Nanoparticle Research, 13(1), 283-291 (2011).
  10. И.И. Фикс, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, И.В. Турчин, «Реконструкция положения объектов для диффузионной флуоресцентной томографии на основе гибридных моделей рассеяния света в биотканях», Известия ВУЗов. Радиофизика, 54(3), 219-233 (2011).
  11. Е.А. Сергеева, А.Р. Катичев, М.Ю. Кириллин, “Формирование сигнала двухфотонной флуоресцентной микроскопии в условиях сильного рассеяния: теоретическое и численное моделирование”, Квантовая Электроника, 40(12), 1053–1061 (2010).
  12. Х.С.С. Сорвойя, Т.С. Мюллюля, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, Р.А. Мюллюля, А.А. Элесуд, Ю. Никкинен, О. Тервонен, В. Кивиниеми, “Неинвазивный МРТ-совместимый волоконно-оптический прибор для функциональной рефлектометрии мозга человека в оптическом и ближнем ИК диапазонах”, Квантовая Электроника, 40(12), 1067-1073 (2010).
  13. M. Kirillin, I. Meglinski, V. Kuzmin, E. Sergeeva and R. Myllylä “Simulation of optical coherence tomography images by Monte Carlo modeling based on polarization vector approach”, Optics Express, 18(21), 21714-21724(2010).
  14. M.Yu. Kirillin, P.D. Agrba and V.A. Kamensky “In vivo study of the effect of mechanical compression on formation of OCT images of human skin”, Journal of Biophotonics, 3(12), 752-758(2010).
  15. М.Ю. Кириллин, П.Д. Агрба, М.А. Сироткина, М.В. Ширманова, Е.В. Загайнова, В.А. Каменский “Контрастирование структурных элементов кожи наночастицами в оптической когерентной томографии: количественная оценка”, Квантовая Электроника, 40(6), 525–530 (2010).
  16. П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, А.И. Абелевич, Е.В. Загайнова, В.А. Каменский, «Компрессия как метод повышения информативности оптической когерентной томографии биотканей», Оптика и спектроскопия, 107(6), 901-906 (2009).
  17. M.Yu. Kirillin, M.V. Shirmanova, M.A. Sirotkina, M.L. Bugrova, B.N. Khlebtsov and E.V. Zagaynova, “Contrasting properties of gold nanoshells and titanium dioxide nanoparticles for OCT imaging of skin: Monte Carlo simulations and in vivo study”, J.Biomed. Opt., 14, 021017 (2009).
  18. I. Meglinski, M. Kirillin, V. Kuzmin and R. Myllylä, “Simulation of Polarization-Sensitive Optical Coherence Tomography images by Monte Carlo method”, Optics Letters, 33(14), 1581-1583 (2008).
  19. E.V. Zagaynova, M.V. Shirmanova, M.Yu. Kirillin, B.N. Khlebtsov, A.G. Orlova, I.V. Balalaeva, M.A. Sirotkina, M.L Bugrova, P.D. Agrba and V.A. Kamensky, “Contrasting properties of gold nanoparticles for optical coherence tomography: phantom, in vivo studies and Monte Carlo simulation”, Phys. Med. Biol.,53, 4995-5009 (2008).
  20. М.Ю. Кириллин, А.В. Быков, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля «Использование временного стробирования при измерении уровня глюкозы в трехслойной модели биоткани с помощью сверхкоротких лазерных импульсов», Квантовая Электроника, 38(5), 486-490(2008).
  21. М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля ”Роль многократного рассеяния при формировании ОКТ изображений кожи”, Квантовая Электроника, 38(6), 570-575(2008).
  22. Е.В. Загайнова, М.В. Ширманова, В.А. Каменский, М.Ю. Кириллин, А.Г. Орлова, И.В. Балалаева, Б.Н. Хлебцов, А.М. Сергеев, ”Исследование контрастирующих свойств золотых наночастиц для метода ОКТ”, Российские Нанотехнологии, 2 (7-8), 135-143 (2007).
  23. M.Yu. Kirillin, E. Alarousu, T. Fabritius, R. Myllylä and A.V. Priezzhev “Visualization of paper structure by optical coherence tomography: Monte Carlo simulations and experimental study”, Journal of the European Optical Society - Rapid Publications, 2, 07031 (2007).
  24. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля, “Моделирование сигнала пространственно-разрешенной рефлектометрии от трехслойной среды с сильным рассеянием применительно к проблеме определения содержания глюкозы в коже человека”, Квантовая Электроника, 36 (12), 1125-1130 (2006).
  25.  Е.А. Сергеева, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Распространение фемтосекундного импульса в рассеивающей среде: теоретический анализ и численное моделирование», Квантовая Электроника, 36 (11), 1023-1031 (2006).
  26. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Монте-Карло моделирование сигналов оптического когерентного томографа и его доплеровского варианта от модельных биологических тканей», Оптика и спектроскопия, 101 (1), 37-43 (2006).
  27. М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, М.С. Федосеева, «Анализ вкладов различных кратностей рассеяния в сигнал оптического когерентного томографа от слоя крови методом Монте-Карло», Вестник МГУ.сер.3. Физика. Астрономия, №2,36-40 (2006).
  28.  М.Ю. Кириллин, И.В. Меглинский, А.В. Приезжев, «Влияние кратностей рассеяния на формирование сигнала в оптической низко-когерентной томографии сильно рассеивающих сред», Квантовая электроника, 36(3), 247-252 (2006).
  29.  М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Ю.Хаст, Р.Мюллюля, «Оптическое просветление бумаги в оптической когерентной томографии: Монте-Карло моделирование», Квантовая электроника, 36(2), 174-180 (2006).
  30.  А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Восстановление профиля скоростей потока суспензии, погруженного в светорассеивающую среду, по сигналу оптического когерентного доплеровского томографа (Монте-Карло моделирование)», Квантовая электроника, 35(11), 1079-1082 (2005).
  31. M.Yu. Kirillin, A.V. Priezzhev, V.V. Tuchin, R.K. Wang and R. Myllylä “Effect of red blood cell aggregation and sedimentation on optical coherence tomography signals from blood samples”, J. Phys. D: Appl. Phys. 38 , pp. 2582-2589 (2005)
  32. А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев. Монте-Карло моделирование сигнала оптического когерентного доплеровского томографа: влияние концентрации частиц в потоке на восстановленный профиль скоростей, Квантовая электроника, 35, 135-139 (2005).
  33.  М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, "Монте-Карло моделирование распространения лазерного пучка в плоском слое суспензии эритроцитов. Сравнение вкладов различных кратностей рассеяния в угловое распределение света", Квантовая электроника, 32(10), 883-887 (2002).

Главы в книгах

  1. A.V. Bykov, M.Yu.Kirillin, A.V. Priezzhev, “Monte Carlo simulation of light propagation in human tissues and noninvasive glucose sensing”, Chapter 3 in Handbook of Optical Sensing of Glucose in Biological Fluids and Tissues (Ed. – V.V.Tuchin), CRC Press, Boca Raton, London, New York, Washington, 2008, pp. 67-98.
  2. V. Gelikonov, G. Gelikonov, M. Kirillin, N. Shakhova, A. Sergeev, N. Gladkova, E. Zagaynova “Fiber-Based OCT: From Optical Design to Clinical Applications”, Chapter 16 in Handbook of Photonics for Biomedical Science (Ed. – V.V. Tuchin), CRC Press, Boca Raton, London, New York, Washington, 2010, pp. 423-444.
  3. М.Ю. Кириллин, И.И. Фикс, А.Р. Катичев, А.В. Горшков, В.П. Гергель, “Высокопроизводительные вычисления для задач оптической биомедицинской диагностики” в сборнике «Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности (третий выпуск)», ред. В.А. Садовничий, Г.И. Савин, Вл.В. Воеводин, М.: Издательство Московского университета, 2012. с. 222-229, ISBN 978-5-211-06345-7.

Редакторские статьи

  1. M. Kirillin, K. König, N. Shakhova, B. Tromberg, A. Semyanov “Optical bioimaging and neuroimaging: from whole-body inspection to brain sensing”, Journal of Biophotonics, 3(12), 741-742 (2010).
  2. M. Kirillin, N. Shakhova, K. Sokolov and R. Steiner “Topical Problems of Biophotonics”, Journal of Biophotonics, 5(11-12), 813-814 (2012).

РИД

  1. Кириллин М.Ю., Турчин И.В., Фикс И.И., Клешнин М.С. «Методика определения пространственного разрешения при исследовании внутренней структуры рассеивающих объектов методом оптической диффузионной томографии (для неразрушающего контроля)», Стандартизированная методика ГСССД МЭ 158 – 2009 (2009).
  2. Кириллин М.Ю., Турчин И.В., Фикс И.И., Клешнин М.С. «Методика определения пространственного разрешения при исследовании внутренней структуры рассеивающих объектов методом диффузионной флуоресцентной томографии (для неразрушающего контроля)», Стандартизированная методика ГСССД МЭ 159 – 2009 (2009).
  3. А.В. Горшков, М.Ю. Кириллин «Моделирование распространения излучения в биотканях для задач оптической диффузионной спектроскопии мозга человека», Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ № 2013611386 (09.01.2013)
  4. М.С. Клешнин, И.В. Турчин, И.И. Фикс, М.Ю. Кириллин, Устройство получения томографических флуоресцентных изображений. Заявка на изобретение РФ № 2012143507 от 12.10.2012
  5. Киселева Е.Б., Гладкова Н.Д., Сергеева Е.А., Кириллин М.Ю., Губарькова Е.В., Карабут М.М., Балалаева И.В., Стрельцова О.С., Робакидзе Н.С., Масленникова А.В., Кочуева М.В., Способ оценки функционального состояния коллагенсодержащих тканей. Заявка на изобретение № 2013135571 от 29.07.2013.

Приглашенные доклады на конференциях

  1. M.Yu. Kirillin, E.A. Sergeeva, P.D. Agrba, E.B. Kiseleva, E.V. Gubarkova, D.O. Ellinsky, I.L. Shlivko, N.D. Gladkova, O.G. Panteleeva, and N.M. Shakhova,  “Interpretation of OCT images in biotissue diagnostics: numerical simulation and analysis” (Invited) , “Topical Problems of Biophotonics 2013”, 21-27 July, Nizhny Novgorod-Myshkin-Kazan, Russia, (2013).
  2. M.Yu. Kirillin, P.D. Agrba, E.A. Sergeeva, E.A. Bakshaeva, M.V. Shirmanova, M.A. Sirotkina, and V.A. Kamensky “Contrast enhancement in optical tomography of biotissues”, “Topical Problems of Biophotonics 2011”, 16-22 July, St.Petersburg-Nizhny Novgorod, Russia (2011).
  3. M.Yu. Kirillin, P.D. Agrba, and V.A. Kamensky “Methods of Contrasting in Optical Coherence Tomography of Biotissues”, ICONO/LAT, 23-27 August, Kazan, Rusisa, LThl1 (2010).
  4. M.Yu. Kirillin, P. Agrba, M. Shirmanova, M. Sirotkina, V. Kamensky, “Image contrasting in optical tomography modalities”, Saratov Fall Meeting 2009 SFM 2009, Saratov, Russia, 21-24 September.
  5. M.Yu. Kirillin and I.V. Meglinski, “Advanced Monte Carlo simulations of optical coherence tomography images”, Saratov Fall Meeting 2008 (SFM 2008), Saratov, Russia, 23-26 September.